Čtyřiatřicetiletý rodák z Havlíčkova Brodu odehrál první zápas v nejvyšší soutěži v barvách pražské Slavie, kde strávil převážnou část kariéry. V extralize si však zahrál také za Mladou Boleslav, Kometu Brno a českobudějovický Mountfield.
Celkem nastřádal mezi tuzemskou elitou 734 startů, v nichž zaznamenal 234 kanadských bodů za 53 gólů a 181 asistencí. Jan Novák má za sebou také několik zahraničních štací, během nichž poznal pět nejvyšších soutěží v Evropě.
Ruskou Superligu či KHL si zahrál v barvách Kazaně a Jekatěrinburgu, finskou SM-Liigu poznal ostřílený harcovník v dresu Kärpätu Oulu a švédskou elitní ligu si vyzkoušel v týmu Skelleftea. V předchozí sezóně nastupoval Jan Novák za italský celek SHC Fassa a rakouský Štýrský Hradec. Letos zahájil ročník v první lize, kde odehrál 24 zápasů, jednou skóroval a přidal čtyři asistence.
Kromě klubové úrovně sbíral Jan Novák zkušenosti také v mezistátních zápasech v barvách národního týmu. V nejcennějším dresu odehrál odchovanec hokeje na Vysočině 34 duelů a čtyřikrát rozvlnil síť v soupeřově brance. Na mistrovství světa 2004, které se konalo v Praze a Ostravě, odehrál všech sedm zápasů a připsali si dvě asistence.
Sezóna Klub Z G A B TM 1995-96 HC Rebel Havlíčkův Brod - dor. (LD) 34 3 8 11 - 1996-97 Hockey Olomouc - dor. (E) 30 2 4 6 - 1997-98 HC Slavia Praha (E) 33 2 3 5 10 HC Slavia Praha (E,p-o) 1 0 0 0 0 HC Slavia Praha - jun. (E) 20 3 6 9 - 1998-99 HC Slavia Praha (E) 40 3 10 13 62 HC Kaučuk Kralupy nad Vltavou (1.liga) 2 0 0 0 - 1999-00 HC Slavia Praha (E) 48 5 4 9 22 HC Slavia Praha - jun. (E) 9 1 2 3 6 HC Slavia Praha - jun. (E,p-o) 6 1 5 6 2 2000-01 HC Slavia Praha (E) 48 2 5 7 59 HC Slavia Praha (E,p-o) 11 0 6 6 4 2001-02 HC Slavia Praha (E) 49 4 12 16 38 HC Slavia Praha (E,p-o) 6 2 1 3 2 2002-03 HC Slavia Praha (E) 49 1 8 9 20 HC Slavia Praha (E,p-o) 15 1 1 2 10 2003-04 HC Slavia Praha (E) 49 12 15 27 59 HC Slavia Praha (E,p-o) 19 3 11 14 16 2004-05 HC Slavia Praha (E) 52 6 30 36 36 HC Slavia Praha (E,p-o) 7 0 1 1 2 2005-06 HC Slavia Praha (E) 52 7 21 28 4 HC Slavia Praha (E,p-o) 15 4 2 6 6 2006-07 Ak Bars Kazaň (RUS1) 33 2 7 9 26 Ak Bars Kazaň (RUS1,p-o) 15 0 3 3 14 Ak Bars Kazaň (ECC) 3 0 0 0 2 2007-08 Kärpät Oulu (FIN1) 19 0 2 2 18 Skelleftea AIK (SWE1) 10 0 1 1 8 HC Slavia Praha (E) 5 1 0 1 8 HC Slavia Praha (E,p-o) 19 2 5 7 36 2008-09 HC Slavia Praha (E) 37 2 8 10 32 BK Mladá Boleslav (E) 12 1 4 5 4 BK Mladá Boleslav (E,ou) 10 0 3 3 6 BK Mladá Boleslav (baráž o E) 4 0 2 2 4 HC Slavia Praha (CHL) 4 1 1 2 8 2009-10 Avtomobilist Jekatěrinburg (KHL) 6 0 0 0 0 HC Kometa Brno (E) 31 1 9 10 32 HC Kometa Brno (E,ou) 12 0 4 4 4 2010-11 HC MOUNTFIELD (E) 51 3 8 11 97 HC MOUNTFIELD (E,p-o) 6 0 0 0 2 2011-12 HC MOUNTFIELD (E) 52 1 7 8 18 HC MOUNTFIELD (E,p-o) 5 0 2 2 4 2012-13 SHC Fassa (ITA1) 26 0 8 8 8 Štýrský Hradec 99ers (EBEL) 23 1 11 12 2 Štýrský Hradec 99ers (EBEL,p-o) 5 0 2 2 4 Celkem extraliga 734 53 181 234 593