Bez deseti centimetrů dvoumetrového obránce koupil Chomutov před třemi lety z pražské Sparty. V následujících dvou sezónách odehrál Malinský 96 utkání v bílomodrém dresu a připsal si 26 kanadských bodů za 5 branek a 21 přesných přihrávek. V minulé sezóně nedostal od trenéra Pešouta důvěru a po dohodě odešel do Popradu.

Ve slovenské extralize nastupoval Ondřej Malinský pravidelně. Odehrál 65 utkání, ve kterých zaznamenal 2 branky a 3 asistence. Po roce stráveném u východních sousedů se nyní znovu zapojil do přípravy ve svém mateřském klubu.