Michal Vondrka pochází z Českých Budějovic, kde začínal s hokejem a odkud se během ročníku 2003/2004 vydal do české metropole a posílil tehdejší úřadující mistry z pražské Slavie. „Sešívaným“ byl věrný až do léta 2011 a podílel se tak historicky druhém titulu na jaře 2008. Pouze v průběhu sezóny 2006/2007 odehrál jedenáct utkání za karlovarskou Energii a během ročníku 2004/2005 krátce vypomohl Hradci Králové s Mladou Boleslaví v první lize.
V dubnu 2011 zveřejnil finský celek Kärpät Oulu zprávu o příchodu českého útočníka, transfer se krátce poté potvrdil a Michal Vondrka tak vyrazil na sever Evropy. Ve zhruba stočtyřicetitisícovém městě na břehu Botnického zálivu ale zůstal jen do poloviny listopadu. Po 21 duelech, v nichž třikrát skóroval a přidal stejný počet asistencí, zamířil zpět do Slavie.
Po skončení sezóny a premiéře na seniorském mistrovství světa 2012 se vydal znovu za hranice České republiky. Tentokrát si vybral působiště blíže, ovšem se Slovanem Bratislava procestoval v rámci Kontinentální hokejové ligy celé Rusko. U našich východních sousedů vydržel až do závěru ročníku 2014/2015. Po spekulacích o finančních problémech tradičního slovenského klubu se rozhodl pro návrat do vlasti. Vybral si Spartu, což vzhledem k jeho slávistické minulosti dodalo změně dresu pikantní nádech.
Holešovičtí vypadli v semifinále s Třincem. Po vyřazení z Česká pojišťovna play-off se Michal Vondrka připojil k národnímu týmu a připsal si třetí start na seniorském mistrovství světa. Předtím si odvezl bronz z Helsinek a Stockholmu 2012 a čtvrté místo z Minsku 2014. Na šampionátu v Praze a Ostravě si jihočeský rodák připsal první góly na MS.
Michal Vondrka se trefil hned v prvním střetnutí, do kterého zasáhl, když proti Německu vyrovnával na 1:1. V poslední bitvě základní skupiny se Švýcarskem pak proměnil rozdílový nájezd v závěrečném rozstřelu. Piráti jsou pro účastníka mistrovství světa hráčů do dvaceti let v Pardubicích a Hradci Králové pátou extraligovou štací, hned v první sezóně byl kapitánem týmu.
Na spolupráci s Romanem Červenkou navázal v ročníku 2016/2017 ještě plodnější souhrou s Ivanem Humlem. Oba zkušení hráči se pohybovali v horních patrech produktivity základní části i play-off, v němž se stal Michal Vondrka nejlepším střelcem. V hlasování extraligových hráčů o nejlepšího hokejistu nejvyšší soutěže se pak dostal na první místo a na slavnostním galavečeru Tipsport extraligy si došel pro cennou trofej. V nominaci Josefa Jandače na světový šampionát v Paříži, kde hráli Češi, a Kolíně nad Rýnem však scházel.
Vše si vynahradil v následující sezóně, kdy byl nominován na své první olympijské hry. Na ty odcestoval chomutovský hráč poprvé po 62 letech a znovu se jednalo o dvojici. Na Miroslava Klůce a Otto Cimrmana navázal kromě Michala Vondrky ještě Juraj Valach v dresu Slovenska. Kapitán Pirátů nastoupil do prvního duelu s domácí Koreou, ale následně z české sestavy vypadl až do bitvy o třetí místo, kterou však celou proseděl ve výstroji na střídačce.
Sezóna Klub Z G A B TM 1999-00 HC České Budějovice - jun. (E) 20 6 3 9 14 HC České Budějovice - jun. (E, p-out) 11 6 4 10 2 2000-01 HC České Budějovice (E) 8 1 0 1 2 KLH Jindřichův Hradec (2. liga, p-o) 1 0 1 1 0 HC České Budějovice - jun. (E) 31 9 14 23 37 HC České Budějovice - jun. (E, p-o) 6 0 0 0 0 2001-02 HC České Budějovice (E) 33 1 1 2 2 IHC Písek (1. liga, p-out) 2 1 0 1 0 HC České Budějovice - jun. (E) 12 2 6 8 6 HC České Budějovice - jun. (E, p-o) 2 1 3 4 2 2002-03 HC České Budějovice (E) 27 1 3 4 4 HC České Budějovice (E, p-o) 3 0 0 0 0 IHC Písek (1. liga) 18 3 2 5 39 IHC Písek (1. liga, p-o) 3 1 0 1 0 HC České Budějovice - jun. (E) 7 4 1 5 4 2003-04 HC České Budějovice (E) 8 1 0 1 0 HC Slavia Praha (E) 37 6 7 13 8 HC Slavia Praha (E, p-o) 19 2 1 3 4 2004-05 HC Slavia Praha (E) 25 5 1 6 12 HC Slavia Praha (E, p-o) 5 0 0 0 2 HC Hradec Králové (1. liga) 9 0 1 1 4 2005-06 HC Slavia Praha (E) 52 6 1 7 24 HC Slavia Praha (E, p-o) 14 1 1 2 0 2006-07 HC Slavia Praha (E) 38 4 5 9 45 HC Slavia Praha (E, p-o) 6 2 2 4 16 HC Karlovy Vary (E) 11 0 0 0 31 2007-08 HC Slavia Praha (E) 52 9 8 17 20 HC Slavia Praha (E, p-o) 19 2 4 6 6 2008-09 HC Slavia Praha (E) 50 9 13 22 40 HC Slavia Praha (E, p-o) 18 6 7 13 12 2009-10 HC Slavia Praha (E) 52 9 26 35 36 HC Slavia Praha (E, p-o) 16 6 7 13 4 2010-11 HC Slavia Praha (E) 52 14 21 35 24 HC Slavia Praha (E, p-o) 19 4 11 15 12 2011-12 Kärpät Oulu (FIN) 21 3 3 6 14 HC Slavia Praha (E) 30 14 17 31 22 HC Slavia Praha (E, p-out) 12 4 5 9 4 2012-13 HC Slovan Bratislava (KHL) 46 9 11 20 18 HC Slovan Bratislava (KHL, p-o) 4 1 1 2 0 2013-14 HC Slovan Bratislava (KHL) 48 12 12 24 18 2014-15 HC Slovan Bratislava (KHL) 45 7 12 19 28 HC Sparta Praha (E) 5 0 2 2 4 HC Sparta Praha (E, p-o) 10 1 1 2 4 2015-16 Piráti Chomutov (E) 39 11 13 24 14 Piráti Chomutov (E, p-o) 8 1 1 2 10 2016-17 Piráti Chomutov (E) 51 23 23 46 30 Piráti Chomutov (E, p-o) 17 10 4 14 4 2017-18 Piráti Chomutov (E) 52 18 25 43 20 Piráti Chomutov (E, p-out) 3 1 2 3 2 Celkem za Chomutov 170 64 68 132 80 Celkem v extralize 791 172 212 384 418 Reprezentace: 2000-01 Česká republika U20 4 0 0 0 0 2001-02 MS U20 (ČR - Pardubice, Hradec Králové) 7 1 1 2 8 Česká republika U20 6 0 0 0 0 2008-09 Česká republika 2 0 0 0 2 2009-10 Česká republika 2 1 0 1 0 2010-11 Česká republika 7 0 1 1 6 2011-12 MS (FIN, SWE - Helsinky, Stockholm) - bronz 9 0 1 1 0 Česká republika 8 0 2 2 2 2012-13 Česká republika 11 2 1 3 4 2013-14 MS (Bělorusko - Minsk) 6 0 0 0 0 Česká republika 11 2 1 3 6 2014-15 MS (ČR - Praha, Ostrava) 5 2 0 2 0 Česká republika 10 4 1 5 2 2016-17 Česká republika 3 1 0 0 2 2017-18 OH (Jižní Korea – Pchjongčchang) 2 0 0 0 0 Česká republika 2 0 2 2 2 Celkem Česká republika 76 12 9 21 26
První zápas v reprezentaci
16. dubna 2009 v Liberci - Česká republika vs. Švédsko 2:1.
První branka v reprezentaci
16. dubna 2010 v Prostějově - Česká republika vs. Slovensko 6:2.